Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarcc2Q6PDG5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarcc2Q6PDG5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcc2Q6PDG5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarcc2Q6PDG5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarcc2Q6PDG5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms