Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6PD19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6PD19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6PD19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6PD19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6PD19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q6PD19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Q6PD19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q6PD19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q6PD19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q6PD19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Q6PD19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Q6PD19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q6PD19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q6PD19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q6PD19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q6PD19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q6PD19 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q6PD19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q6PD19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q6PD19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6PD19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6PD19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6PD19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6PD19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q6PD19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q6PD19 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q6PD19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6PD19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6PD19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6PD19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6PD19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6PD19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q6PD19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q6PD19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q6PD19 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q6PD19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q6PD19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q6PD19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q6PD19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q6PD19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q6PD19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q6PD19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q6PD19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q6PD19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q6PD19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q6PD19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q6PD19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6PD19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6PD19 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6PD19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6PD19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6PD19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q6PD19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q6PD19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q6PD19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q6PD19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q6PD19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q6PD19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q6PD19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q6PD19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q6PD19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q6PD19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q6PD19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q6PD19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q6PD19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q6PD19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q6PD19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q6PD19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6PD19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6PD19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6PD19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q6PD19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q6PD19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q6PD19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q6PD19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q6PD19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q6PD19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6PD19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6PD19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6PD19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6PD19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q6PD19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q6PD19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q6PD19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q6PD19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q6PD19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms