Protein–RNA interactions for Protein: Q6P566

Lix1, Protein limb expression 1 homolog, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lix1Q6P566 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lix1Q6P566 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lix1Q6P566 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lix1Q6P566 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lix1Q6P566 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lix1Q6P566 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lix1Q6P566 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms