Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx19Q6P4T1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx19Q6P4T1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx19Q6P4T1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx19Q6P4T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms