Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp2r2aQ6P1F6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp2r2aQ6P1F6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp2r2aQ6P1F6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms