Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Slx4Q6P1D7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Slx4Q6P1D7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Slx4Q6P1D7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Slx4Q6P1D7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Slx4Q6P1D7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Slx4Q6P1D7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Slx4Q6P1D7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Slx4Q6P1D7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Slx4Q6P1D7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Slx4Q6P1D7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Slx4Q6P1D7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms