Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltv1Q6NSQ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltv1Q6NSQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltv1Q6NSQ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ltv1Q6NSQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ltv1Q6NSQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ltv1Q6NSQ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms