Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg16l2Q6KAU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg16l2Q6KAU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg16l2Q6KAU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l2Q6KAU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms