Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn11Q6J756 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn11Q6J756 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn11Q6J756 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms