Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nop58Q6DFW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nop58Q6DFW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nop58Q6DFW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nop58Q6DFW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nop58Q6DFW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.4 ms