Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx11Q6AXC6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx11Q6AXC6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx11Q6AXC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ddx11Q6AXC6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx11Q6AXC6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx11Q6AXC6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx11Q6AXC6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms