Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp7Q6A4J8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp7Q6A4J8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp7Q6A4J8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp7Q6A4J8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms