Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpalpp1Q69ZC8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpalpp1Q69ZC8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpalpp1Q69ZC8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpalpp1Q69ZC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpalpp1Q69ZC8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpalpp1Q69ZC8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms