Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf280dQ68FE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf280dQ68FE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znf280dQ68FE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf280dQ68FE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf280dQ68FE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf280dQ68FE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms