Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab3ipQ68EF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab3ipQ68EF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab3ipQ68EF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms