Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Papd5Q68ED3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Papd5Q68ED3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Papd5Q68ED3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Papd5Q68ED3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Papd5Q68ED3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms