Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nup62Q63850 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nup62Q63850 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nup62Q63850 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nup62Q63850 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms