Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp1Q62442 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vamp1Q62442 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp1Q62442 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms