Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcanQ62059 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcanQ62059 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VcanQ62059 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VcanQ62059 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VcanQ62059 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcanQ62059 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcanQ62059 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcanQ62059 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VcanQ62059 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VcanQ62059 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcanQ62059 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VcanQ62059 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcanQ62059 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms