Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itm2aQ61500 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itm2aQ61500 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itm2aQ61500 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itm2aQ61500 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2aQ61500 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms