Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd53Q61451 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd53Q61451 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd53Q61451 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd53Q61451 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd53Q61451 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd53Q61451 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd53Q61451 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd53Q61451 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd53Q61451 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd53Q61451 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd53Q61451 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd53Q61451 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd53Q61451 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd53Q61451 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd53Q61451 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd53Q61451 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd53Q61451 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd53Q61451 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd53Q61451 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms