Protein–RNA interactions for Protein: Q61321

Six4, Homeobox protein SIX4, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six4Q61321 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Six4Q61321 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six4Q61321 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Six4Q61321 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six4Q61321 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six4Q61321 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six4Q61321 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six4Q61321 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six4Q61321 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six4Q61321 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six4Q61321 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six4Q61321 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six4Q61321 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six4Q61321 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six4Q61321 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six4Q61321 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms