Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lcp1Q61233 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lcp1Q61233 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcp1Q61233 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcp1Q61233 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lcp1Q61233 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcp1Q61233 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms