Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psen2Q61144 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psen2Q61144 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psen2Q61144 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psen2Q61144 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Psen2Q61144 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Psen2Q61144 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psen2Q61144 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psen2Q61144 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psen2Q61144 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psen2Q61144 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psen2Q61144 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psen2Q61144 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psen2Q61144 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psen2Q61144 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Psen2Q61144 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psen2Q61144 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psen2Q61144 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psen2Q61144 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Psen2Q61144 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psen2Q61144 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psen2Q61144 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psen2Q61144 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen2Q61144 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen2Q61144 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms