Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PmlQ60953 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmlQ60953 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PmlQ60953 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PmlQ60953 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmlQ60953 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmlQ60953 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmlQ60953 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmlQ60953 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmlQ60953 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PmlQ60953 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PmlQ60953 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PmlQ60953 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PmlQ60953 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PmlQ60953 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms