Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caprin1Q60865 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Caprin1Q60865 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin1Q60865 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caprin1Q60865 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms