Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3Q60803 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf3Q60803 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf3Q60803 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf3Q60803 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Traf3Q60803 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf3Q60803 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms