Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SkilQ60665 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SkilQ60665 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SkilQ60665 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SkilQ60665 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SkilQ60665 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SkilQ60665 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SkilQ60665 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SkilQ60665 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SkilQ60665 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SkilQ60665 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SkilQ60665 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SkilQ60665 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SkilQ60665 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SkilQ60665 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SkilQ60665 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SkilQ60665 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SkilQ60665 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SkilQ60665 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms