Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm1Q60636 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm1Q60636 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm1Q60636 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm1Q60636 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm1Q60636 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm1Q60636 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm1Q60636 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm1Q60636 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms