Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CttnQ60598 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CttnQ60598 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CttnQ60598 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CttnQ60598 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CttnQ60598 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CttnQ60598 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CttnQ60598 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CttnQ60598 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CttnQ60598 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CttnQ60598 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CttnQ60598 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CttnQ60598 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CttnQ60598 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CttnQ60598 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CttnQ60598 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms