Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q5XFZ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q5XFZ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q5XFZ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q5XFZ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q5XFZ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q5XFZ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms