Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lhfpl4Q5U4E0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhfpl4Q5U4E0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhfpl4Q5U4E0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lhfpl4Q5U4E0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lhfpl4Q5U4E0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl4Q5U4E0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhfpl4Q5U4E0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms