Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc125Q5U465 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc125Q5U465 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc125Q5U465 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc125Q5U465 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms