Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NkaplQ5SZT7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NkaplQ5SZT7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NkaplQ5SZT7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NkaplQ5SZT7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkaplQ5SZT7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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