Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYH2

Tmem199, Transmembrane protein 199, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem199Q5SYH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem199Q5SYH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem199Q5SYH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem199Q5SYH2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem199Q5SYH2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem199Q5SYH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmem199Q5SYH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem199Q5SYH2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms