Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms