Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc85aQ5SP85 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc85aQ5SP85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc85aQ5SP85 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc85aQ5SP85 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc85aQ5SP85 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms