Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Scarf1Q5ND28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scarf1Q5ND28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf1Q5ND28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scarf1Q5ND28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scarf1Q5ND28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms