Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt2Q5DTW2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt2Q5DTW2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt2Q5DTW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms