Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Urb1Q571H0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Urb1Q571H0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb1Q571H0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Urb1Q571H0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Urb1Q571H0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Urb1Q571H0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Urb1Q571H0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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