Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccnl1Q52KE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccnl1Q52KE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccnl1Q52KE7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccnl1Q52KE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccnl1Q52KE7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccnl1Q52KE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms