Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Shank3Q4ACU6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Shank3Q4ACU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shank3Q4ACU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shank3Q4ACU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shank3Q4ACU6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shank3Q4ACU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms