Protein–RNA interactions for Protein: Q497P9

Gm5941, MCG112829, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5941Q497P9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5941Q497P9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5941Q497P9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5941Q497P9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5941Q497P9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5941Q497P9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5941Q497P9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5941Q497P9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5941Q497P9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5941Q497P9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5941Q497P9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms