Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6430531B16RikQ3V2J1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
6430531B16RikQ3V2J1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430531B16RikQ3V2J1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430531B16RikQ3V2J1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
6430531B16RikQ3V2J1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 580.6 ms