Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930432M17RikQ3V0W9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
4930432M17RikQ3V0W9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930432M17RikQ3V0W9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms