Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3V0E1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3V0E1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3V0E1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3V0E1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3V0E1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q3V0E1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3V0E1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q3V0E1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q3V0E1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3V0E1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3V0E1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q3V0E1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1844.3 ms