Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncbp1Q3UYV9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncbp1Q3UYV9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncbp1Q3UYV9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncbp1Q3UYV9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncbp1Q3UYV9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms