Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pfdn4Q3UWL8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pfdn4Q3UWL8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pfdn4Q3UWL8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pfdn4Q3UWL8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfdn4Q3UWL8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms