Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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D130052B06RikQ3UW13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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D130052B06RikQ3UW13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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D130052B06RikQ3UW13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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D130052B06RikQ3UW13 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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D130052B06RikQ3UW13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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D130052B06RikQ3UW13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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D130052B06RikQ3UW13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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D130052B06RikQ3UW13 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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D130052B06RikQ3UW13 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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D130052B06RikQ3UW13 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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D130052B06RikQ3UW13 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
D130052B06RikQ3UW13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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D130052B06RikQ3UW13 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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