Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1lQ3USQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syndig1lQ3USQ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1lQ3USQ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Syndig1lQ3USQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms